Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERCC8Q13216 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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ERCC8Q13216 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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