Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
PPFIA1Q13136 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PPFIA1Q13136 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms