Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ECH1Q13011 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ECH1Q13011 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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