Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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