Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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