Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TOP1MTQ969P6 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TOP1MTQ969P6 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TOP1MTQ969P6 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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