Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
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