Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TPRNQ4KMQ1 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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