Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPN21Q16825 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms