Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ME3Q16798 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ME3Q16798 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ME3Q16798 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ME3Q16798 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ME3Q16798 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ME3Q16798 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ME3Q16798 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ME3Q16798 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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