Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VAMP3Q15836 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VAMP3Q15836 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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