Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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GPNMBQ14956 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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GPNMBQ14956 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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GPNMBQ14956 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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GPNMBQ14956 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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GPNMBQ14956 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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GPNMBQ14956 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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