Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMC1AQ14683 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMC1AQ14683 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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