| RUNX3 | Q13761 | AC009930.1-201 | ENST00000522330 | 191 nt | TSL 5 BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR7111-201 | ENST00000619751 | 72 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091895.1-201 | ENST00000624494 | 256 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SKIL-204 | ENST00000458537 | 7182 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1266P-201 | ENST00000362794 | 105 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.116-201 | ENST00000363292 | 103 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-22P-201 | ENST00000363334 | 158 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-117P-201 | ENST00000365415 | 107 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.396-201 | ENST00000383949 | 103 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.483-201 | ENST00000384380 | 101 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD116-13-201 | ENST00000384408 | 92 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-505P-201 | ENST00000384427 | 107 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.574-201 | ENST00000384766 | 95 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ48-201 | ENST00000390489 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR873-201 | ENST00000401120 | 77 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1253-201 | ENST00000408273 | 105 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-61P-201 | ENST00000411069 | 191 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P55-201 | ENST00000471178 | 356 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS27P22-201 | ENST00000478056 | 241 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097462.1-201 | ENST00000514125 | 324 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-63P-201 | ENST00000516690 | 95 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090124.1-201 | ENST00000525097 | 448 nt | TSL 3 BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092138.2-201 | ENST00000563811 | 428 nt | TSL 5 BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4438-201 | ENST00000585271 | 93 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR6078-201 | ENST00000611069 | 100 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U6.73-201 | ENST00000619194 | 103 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006435.5-201 | ENST00000624486 | 112 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245060.5-201 | ENST00000610778 | 3293 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010615.1-201 | ENST00000594254 | 1764 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.47-201 | ENST00000362697 | 108 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.84-201 | ENST00000363011 | 104 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-80P-201 | ENST00000363200 | 141 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-324P-201 | ENST00000363957 | 106 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA63D-201 | ENST00000364359 | 132 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1019P-201 | ENST00000364424 | 107 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-53P-201 | ENST00000365367 | 106 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.376-201 | ENST00000365638 | 108 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00583-201 | ENST00000381010 | 387 nt | TSL 2 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-21P-201 | ENST00000384710 | 107 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR515-2-201 | ENST00000384883 | 83 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR515-1-201 | ENST00000384884 | 83 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR518E-201 | ENST00000385252 | 88 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1186P-201 | ENST00000410429 | 97 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EBAG9P1-201 | ENST00000418955 | 543 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073323.1-201 | ENST00000419832 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL592431.2-201 | ENST00000422198 | 171 nt | TSL 3 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL513185.1-201 | ENST00000431638 | 162 nt | TSL 5 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP20-201 | ENST00000515976 | 84 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-970P-201 | ENST00000516312 | 107 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA31.17-201 | ENST00000516953 | 127 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP437-201 | ENST00000517249 | 129 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084364.2-201 | ENST00000546924 | 395 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3684-201 | ENST00000579779 | 74 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRR13P7-201 | ENST00000605538 | 430 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD113-5-201 | ENST00000607261 | 78 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001282.2-201 | ENST00000616149 | 309 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TTK-211 | ENST00000627129 | 240 nt | TSL 5 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPP2R5A-205 | ENST00000537030 | 1719 nt | TSL 2 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP11C-202 | ENST00000361648 | 6010 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC25A46-204 | ENST00000504098 | 2345 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.152-201 | ENST00000363578 | 100 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.224-201 | ENST00000364308 | 111 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP363-201 | ENST00000365072 | 115 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.383-201 | ENST00000383855 | 97 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-574P-201 | ENST00000384265 | 107 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC078851.1-201 | ENST00000415918 | 298 nt | TSL 3 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP9-201 | ENST00000431021 | 303 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPE1P21-201 | ENST00000438283 | 308 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND3P2-201 | ENST00000438452 | 342 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS27P1-201 | ENST00000450552 | 247 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P45-201 | ENST00000471748 | 340 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1337P-201 | ENST00000516525 | 95 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP102-201 | ENST00000516865 | 106 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024995.1-201 | ENST00000523014 | 93 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4713-201 | ENST00000582691 | 75 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006380.1-201 | ENST00000603598 | 186 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073413.2-201 | ENST00000604332 | 360 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161716.1-201 | ENST00000606365 | 273 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | 5S_rRNA.13-201 | ENST00000622298 | 123 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLD1-217 | ENST00000627725 | 174 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TPTE2-204 | ENST00000400103 | 1652 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-290P-201 | ENST00000365212 | 101 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA4.2-201 | ENST00000365313 | 147 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-997P-201 | ENST00000384725 | 107 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR320A-201 | ENST00000385302 | 82 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP109-201 | ENST00000391010 | 116 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1203P-201 | ENST00000410703 | 110 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL390729.2-201 | ENST00000416137 | 156 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL163195.1-201 | ENST00000496941 | 348 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEPT14P8-201 | ENST00000508026 | 178 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO2P24-201 | ENST00000515611 | 426 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL137100.2-201 | ENST00000555786 | 315 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022217.4-201 | ENST00000604389 | 163 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004832.4-201 | ENST00000608952 | 331 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR8062-201 | ENST00000621515 | 85 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEMG2-201 | ENST00000372769 | 2051 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SERPINI2-207 | ENST00000476257 | 1837 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPN22-206 | ENST00000525799 | 2118 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA1551-201 | ENST00000312561 | 6230 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |