Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RUNX3Q13761 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
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