Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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