Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE2V1Q13404 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE2V1Q13404 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
UBE2V1Q13404 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE2V1Q13404 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms