Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATMQ13315 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ATMQ13315 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
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