Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
PRDM2Q13029 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
PRDM2Q13029 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PRDM2Q13029 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PRDM2Q13029 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PRDM2Q13029 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PRDM2Q13029 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PRDM2Q13029 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PRDM2Q13029 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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