Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TTPAP49638 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TTPAP49638 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TTPAP49638 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TTPAP49638 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TTPAP49638 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TTPAP49638 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TTPAP49638 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TTPAP49638 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TTPAP49638 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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