Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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RPL28P46779 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPL28P46779 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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RPL28P46779 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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RPL28P46779 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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RPL28P46779 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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RPL28P46779 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPL28P46779 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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RPL28P46779 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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RPL28P46779 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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RPL28P46779 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPL28P46779 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPL28P46779 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
RPL28P46779 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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