Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPOP30536 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPOP30536 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPOP30536 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPOP30536 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPOP30536 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPOP30536 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TSPOP30536 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TSPOP30536 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TSPOP30536 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms