Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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PTPRBP23467 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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PTPRBP23467 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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PTPRBP23467 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
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PTPRBP23467 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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PTPRBP23467 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
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PTPRBP23467 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPRBP23467 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRBP23467 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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