Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPREB1P12018 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms