Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CRXO43186 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CRXO43186 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CRXO43186 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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