Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHCHD4Q8N4Q1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHCHD4Q8N4Q1 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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