Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZNF239Q16600 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZNF239Q16600 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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