Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
HMGN3Q15651 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HMGN3Q15651 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HMGN3Q15651 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HMGN3Q15651 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HMGN3Q15651 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms