Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SYCP1Q15431 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SYCP1Q15431 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SYCP1Q15431 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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SYCP1Q15431 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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SYCP1Q15431 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SYCP1Q15431 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SYCP1Q15431 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SYCP1Q15431 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SYCP1Q15431 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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