Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
PTPRKQ15262 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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