Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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