Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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GPNMBQ14956 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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GPNMBQ14956 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
GPNMBQ14956 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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