Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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CHD4Q14839 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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CHD4Q14839 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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CHD4Q14839 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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CHD4Q14839 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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CHD4Q14839 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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CHD4Q14839 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHD4Q14839 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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CHD4Q14839 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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