| BECN1 | Q14457 | U6.92-201 | ENST00000636464 | 89 nt | BASIC | 1.43 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | CCDC68-202 | ENST00000432185 | 4014 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.43 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | ZNF209P-201 | ENST00000593450 | 2304 nt | BASIC | 1.43 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | SNORA1B-201 | ENST00000362535 | 133 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.101-201 | ENST00000363154 | 102 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.124-201 | ENST00000363339 | 93 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.197-201 | ENST00000364004 | 102 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.361-201 | ENST00000365515 | 120 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.419-201 | ENST00000384041 | 102 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-20P-201 | ENST00000384106 | 107 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-424P-201 | ENST00000384367 | 105 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
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| BECN1 | Q14457 | RNU4-62P-201 | ENST00000410125 | 130 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
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| BECN1 | Q14457 | AC022028.1-201 | ENST00000412054 | 408 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL049830.1-201 | ENST00000468034 | 425 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNA5SP168-201 | ENST00000516642 | 112 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU4-77P-201 | ENST00000516692 | 156 nt | BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | ZNF436-AS1-205 | ENST00000518600 | 376 nt | TSL 5 BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | HS1BP3-208 | ENST00000631166 | 78 nt | TSL 5 BASIC | 1.42 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | ZNF260-203 | ENST00000588993 | 4174 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.39-201 | ENST00000362620 | 98 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.80-201 | ENST00000362996 | 102 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
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| BECN1 | Q14457 | AC108667.1-201 | ENST00000428618 | 249 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | RPS29P28-201 | ENST00000446439 | 141 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
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| BECN1 | Q14457 | LINC02514-201 | ENST00000509058 | 498 nt | TSL 3 BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-1291P-201 | ENST00000516591 | 104 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-1096P-201 | ENST00000517089 | 102 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | MIR3124-201 | ENST00000582636 | 67 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | MIR5188-201 | ENST00000583467 | 113 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | MIR3660-201 | ENST00000584845 | 100 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL080274.1-201 | ENST00000605565 | 220 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL138825.1-201 | ENST00000618587 | 192 nt | BASIC | 1.41 | □□□□□ -2.18 | | |
| BECN1 | Q14457 | TDRD15-202 | ENST00000622654 | 5805 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | UBE3A-225 | ENST00000636667 | 5726 nt | TSL 5 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.230-201 | ENST00000364348 | 109 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC233266.1-201 | ENST00000454518 | 96 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC092991.1-201 | ENST00000477176 | 376 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-1170P-201 | ENST00000515974 | 106 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | C8orf59P2-201 | ENST00000603441 | 271 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | SNORD58B-201 | ENST00000607313 | 66 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | ST7-AS1_1.1-201 | ENST00000611142 | 116 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC006157.1-201 | ENST00000611750 | 366 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC242852.1-201 | ENST00000612151 | 96 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC244015.1-201 | ENST00000622301 | 99 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL606534.2-204 | ENST00000635008 | 178 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNY1P14-201 | ENST00000384426 | 108 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.509-201 | ENST00000384506 | 99 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-482P-201 | ENST00000391068 | 107 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL160004.2-201 | ENST00000432935 | 350 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU1-92P-201 | ENST00000517017 | 135 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC100807.1-201 | ENST00000517640 | 552 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | DNAJC19P9-201 | ENST00000555084 | 351 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC084882.1-201 | ENST00000561254 | 555 nt | TSL 4 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AP001178.1-201 | ENST00000584679 | 268 nt | TSL 3 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | GHRLOS.1-201 | ENST00000610995 | 70 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC106754.2-201 | ENST00000623006 | 233 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | LRRD1-203 | ENST00000430130 | 2661 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | MIR369-201 | ENST00000362155 | 70 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNA5SP327-201 | ENST00000362494 | 101 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | SNORA2.2-201 | ENST00000365473 | 135 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.431-201 | ENST00000384086 | 102 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-136P-201 | ENST00000384663 | 107 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | MIR653-201 | ENST00000385279 | 96 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | U8.16-201 | ENST00000391279 | 133 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL451046.2-201 | ENST00000403074 | 277 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-1199P-201 | ENST00000411249 | 104 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | CALM2P4-201 | ENST00000430810 | 426 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU7-12P-201 | ENST00000516030 | 62 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | SNORA40.14-201 | ENST00000516543 | 86 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC022616.4-201 | ENST00000522985 | 181 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC090049.2-201 | ENST00000550377 | 109 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | MIR4778-201 | ENST00000577635 | 80 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | C18orf54-203 | ENST00000578138 | 776 nt | TSL 3 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC022596.1-201 | ENST00000582895 | 302 nt | TSL 5 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | MIR4769-201 | ENST00000584126 | 77 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | Metazoa_SRP.32-201 | ENST00000622685 | 286 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | uc_338.22-201 | ENST00000622722 | 187 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | UHRF1BP1L-203 | ENST00000545232 | 4088 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.112-201 | ENST00000363250 | 102 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | Y_RNA.446-201 | ENST00000384178 | 104 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-1105P-201 | ENST00000384774 | 107 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL031003.1-201 | ENST00000404229 | 172 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL162725.1-201 | ENST00000435405 | 301 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | U8.19-201 | ENST00000459095 | 133 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL133373.1-201 | ENST00000497098 | 94 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC108516.1-201 | ENST00000503666 | 257 nt | TSL 2 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-966P-201 | ENST00000516479 | 104 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-63P-201 | ENST00000516690 | 95 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | RPS29P30-201 | ENST00000600975 | 111 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL357312.1-201 | ENST00000603879 | 298 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL512598.1-201 | ENST00000610158 | 273 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |