Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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ATRQ13535 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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