Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TCIRG1Q13488 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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