Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TOP3AQ13472 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TOP3AQ13472 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TOP3AQ13472 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TOP3AQ13472 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms