| NME3 | Q13232 | AL049830.1-201 | ENST00000468034 | 425 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC111194.2-201 | ENST00000511222 | 455 nt | TSL 5 BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1337P-201 | ENST00000516525 | 95 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNA5SP404-201 | ENST00000517118 | 132 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC090049.2-201 | ENST00000550377 | 109 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AL355073.2-201 | ENST00000612106 | 557 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC011476.5-201 | ENST00000615594 | 130 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | MTND4LP32-201 | ENST00000636111 | 270 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | JMJD1C-212 | ENST00000639129 | 7901 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | NPAT-201 | ENST00000278612 | 6117 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR337-201 | ENST00000362281 | 93 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.164-201 | ENST00000363709 | 102 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AL451046.2-201 | ENST00000403074 | 277 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AL354751.2-201 | ENST00000415471 | 210 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | CEP57L1P1-201 | ENST00000430943 | 1201 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | SUMO1P2-201 | ENST00000452524 | 304 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | ELOCP24-201 | ENST00000456370 | 334 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.653-201 | ENST00000459091 | 95 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-947P-201 | ENST00000516264 | 106 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-966P-201 | ENST00000516479 | 104 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC099654.14-201 | ENST00000638599 | 341 nt | BASIC | 1.06 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-708P-201 | ENST00000384217 | 107 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD116-13-201 | ENST00000384408 | 92 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-939P-201 | ENST00000384634 | 107 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR222-201 | ENST00000384992 | 110 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR559-201 | ENST00000385188 | 96 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | TRAJ3-201 | ENST00000390534 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AL031003.1-201 | ENST00000404229 | 172 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | NCOA7-AS1-201 | ENST00000429007 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC096644.2-201 | ENST00000429278 | 159 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RPS29P28-201 | ENST00000446439 | 141 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RPS4XP11-201 | ENST00000446897 | 772 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | FCF1P4-201 | ENST00000448326 | 183 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | OR2A41P-201 | ENST00000473586 | 105 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU7-4P-201 | ENST00000516961 | 62 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC240442.1-201 | ENST00000616055 | 283 nt | BASIC | 1.05 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.4-201 | ENST00000362333 | 112 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD114-7-201 | ENST00000362520 | 77 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.172-201 | ENST00000363765 | 102 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU4-38P-201 | ENST00000364472 | 129 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.314-201 | ENST00000365114 | 102 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1283P-201 | ENST00000365314 | 105 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA2.2-201 | ENST00000365473 | 135 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1080P-201 | ENST00000383982 | 107 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNY3P4-201 | ENST00000384428 | 101 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD116-29-201 | ENST00000384516 | 83 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR526A1-201 | ENST00000384897 | 85 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-910P-201 | ENST00000390844 | 107 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.605-201 | ENST00000410577 | 105 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | HSPE1P13-201 | ENST00000451143 | 297 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC082651.2-201 | ENST00000496833 | 166 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-277P-201 | ENST00000516272 | 106 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC144568.1-201 | ENST00000520139 | 137 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC025580.2-205 | ENST00000559960 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AC138305.3-201 | ENST00000624988 | 240 nt | BASIC | 1.04 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU4-79P-201 | ENST00000362764 | 141 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.363-201 | ENST00000365529 | 113 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1297P-201 | ENST00000384415 | 104 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD78.2-201 | ENST00000391076 | 69 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6ATAC8P-201 | ENST00000408460 | 126 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU2-54P-201 | ENST00000410299 | 190 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AL365434.1-201 | ENST00000412362 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | PIGPP3-201 | ENST00000425307 | 415 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AL162725.1-201 | ENST00000435405 | 301 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | CHEK2P4-201 | ENST00000450340 | 246 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RPS23P4-201 | ENST00000487908 | 423 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1012P-201 | ENST00000516606 | 109 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA70.22-201 | ENST00000517160 | 124 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | AL358944.1-201 | ENST00000528537 | 144 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | U2.1-201 | ENST00000618978 | 145 nt | BASIC | 1.03 | □□□□□ -2.24 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD68-201 | ENST00000363214 | 84 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.259-201 | ENST00000364619 | 101 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA22-201 | ENST00000383907 | 134 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-20P-201 | ENST00000384106 | 107 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA22C-201 | ENST00000384614 | 134 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.621-201 | ENST00000411065 | 96 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1199P-201 | ENST00000411249 | 104 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1054P-201 | ENST00000411293 | 104 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | AC092813.2-201 | ENST00000434540 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | AL353747.2-201 | ENST00000439207 | 205 nt | TSL 3 BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | AC245047.7-201 | ENST00000440265 | 293 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | AL844175.1-201 | ENST00000455153 | 323 nt | TSL 5 BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | PRDX4P1-201 | ENST00000507189 | 574 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-322P-201 | ENST00000516010 | 103 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORD116-28-201 | ENST00000516123 | 91 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | AC005176.2-201 | ENST00000596933 | 147 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | AC120024.3-201 | ENST00000603167 | 156 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | AC006380.1-201 | ENST00000603598 | 186 nt | BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | ZNF518A-210 | ENST00000624776 | 7994 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.02 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | Y_RNA.142-201 | ENST00000363491 | 102 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU1-124P-201 | ENST00000363861 | 145 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR628-201 | ENST00000385229 | 95 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | RNY4P36-201 | ENST00000391116 | 96 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA31.4-201 | ENST00000516049 | 129 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | SNORA70.12-201 | ENST00000516084 | 153 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-155P-201 | ENST00000516347 | 100 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | RNA5SP102-201 | ENST00000516865 | 106 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-699P-201 | ENST00000517081 | 110 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR4659A-201 | ENST00000580269 | 81 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |
| NME3 | Q13232 | FAM106DP-201 | ENST00000586416 | 501 nt | BASIC | 1.01 | □□□□□ -2.25 | | |