Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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BNIP1Q12981 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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BNIP1Q12981 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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BNIP1Q12981 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BNIP1Q12981 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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BNIP1Q12981 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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BNIP1Q12981 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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BNIP1Q12981 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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BNIP1Q12981 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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