Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RBBP4Q09028 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms