Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PUF60Q9UHX1 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PUF60Q9UHX1 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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