Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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