Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN3AQ9NY46 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN3AQ9NY46 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN3AQ9NY46 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SCN3AQ9NY46 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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