Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
IMPG1Q17R60 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
IMPG1Q17R60 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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