Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAMP3Q15836 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 556.2 ms