Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAM2Q15035 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAM2Q15035 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms