Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMCO1Q147U7 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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