Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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TCOF1Q13428 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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TCOF1Q13428 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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TCOF1Q13428 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TCOF1Q13428 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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