Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CBX3Q13185 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CBX3Q13185 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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