Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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GTF3C1Q12789 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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GTF3C1Q12789 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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GTF3C1Q12789 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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GTF3C1Q12789 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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GTF3C1Q12789 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C1Q12789 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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