Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERFP50548 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERFP50548 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERFP50548 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERFP50548 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ERFP50548 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ERFP50548 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms